氣相色譜儀氣源選用無非就是氣體的一個純度問題，對于新手而言，這確實是一個比較復雜的問題。
　　在選擇氣體純度時，主要有3點：
　　色譜柱中填充物；
　　分析對象；
　　檢測器。
　　建議在滿足分析要求的前提下，盡可能選用純度較高的氣體。這樣不但會提高氣相色譜儀的高靈敏度，而且會延長色譜柱，整臺儀器的壽命。
　　氣相色譜儀氣源部分主要由載氣、燃氣、助燃氣這3個部分組成。使用何種類型的載氣由檢測器決定，通常氫火焰檢測器（FID）用氮氣，熱導池（TCD）檢測器用氦氣，無論使用何種載氣都要求是高純（99.99%）氣體。一般載氣進入色譜系統前都需進過凈化，所謂凈化，就是出去載氣中的一些有機物、微量氧、水分等雜質，以提高載氣的的純度，不純凈的載氣可導致柱失效、樣品變化、系統不穩定。
　　使用氫火焰檢測器其色譜可導致基線噪聲增大、基線飄移、假峰、柱流失和縮短柱壽命；使用熱導檢測器其色譜可導致線性變差等。所以載氣必須經過凈化，采用分子篩、硅膠等吸附劑去除各載氣中的水分，采用分子篩、活性炭等吸附劑去除有機雜質。
　　每次分析樣品前都需檢查硅膠是否變色，若有（已變色2/3）則更換，特別是夏天潮濕的陰雨天氣，需勤換。對氫氣發生器的維護還應注意經常加去離子水或堿液。