根據分析對象，色譜柱的類型，操縱儀器的檔次和具體檢測器，若使用分歧要求的低純度氣體，不良影響有以下幾種可能：

　　1.樣品失真或消失：如H2O氣使氯硅樣品水解；

　　2.色譜柱失效：H2O，CO2使分子篩柱失往活性，H2O氣使聚脂類固定液分解，O2使PEG固定液斷鏈；

　　3.有時某些氣體雜質和固定液相互作用而產生假峰；

　　4.對柱保存特性的影響：如H2O對聚乙二醇等親水性固定液的保存指數會有所增加，載氣中氧含量過高時，無論是極性或是非極性固定液柱的保存特性，都會產生變化，使用時間越長影響越大；

　　5.檢測器：TCD：信噪比減小，無法調另，線性變窄，校正因子不能使用，氧含量過大，使元件在高溫時加速老化，減少壽命。

　　氣相色譜儀氣源通常用于常規分析,對于特殊高靈敏度的痕量分析應采用高一級純度的氣體,假如不在意色譜柱和儀器的使用壽命,或分析樣品組分濃度很高時,也可以不使用過高純度的氣體,由于各個制氣廠設置不同，其雜質含量將有所不同;為滿足不同的使用要求,選用不同廠家不同純度的氣源后,可以通過氣體凈化處理滿足分析要求。